Zur Isolierung der Fullerene geht man von fullerenhaltigem Ruß aus. Diesen kann man kaufen oder selber herstellen. Letzteres ist allerdings recht schwierig und setzt einen gewissen apparativen Aufwand voraus.
Der Ruß wird mit Lösemitteln wie Toluol extrahiert (siehe Experimente, V 1). Man erhält eine braune Lösung eines Fullerengemisches, kurz "Fullerit" genannt.
Aus dem Fullerengemisch wird das eigentliche Buckminsterfulleren C₆₀ durch Säulenchromatographie abgetrennt (siehe Experimente, V 2).

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